孩子打完百白破疫苗后发烧39°C，可能是疫苗的不良反应，也可能是其他原因引起的感染。以下是一些可能的原因和应对方法：
1.疫苗不良反应：百白破疫苗是一种联合疫苗，含有百日咳、白喉和破伤风三种抗原。接种后，孩子可能会出现一些不良反应，其中发烧是比较常见的一种。通常，发烧会在接种后24-48小时内出现，体温可能会达到38.5°C以上。这种发烧一般会持续1-2天，不需要特殊处理，只需要让孩子多喝水，注意休息，保持身体清洁即可。如果孩子体温超过38.5°C，可以给孩子服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚。
2.感染：接种疫苗后，孩子的免疫力可能会暂时下降，容易感染细菌或病毒，从而引起发烧。如果孩子除了发烧外，还伴有咳嗽、流鼻涕、喉咙痛等症状，可能是感冒或其他呼吸道感染引起的。此时，需要带孩子去医院看医生，进行相关检查和治疗。
3.其他原因：孩子打完百白破疫苗后发烧39°C，还可能是其他原因引起的，如疫苗过敏、接种部位感染等。如果孩子出现皮疹、呼吸困难、呕吐、腹泻等症状，或者接种部位出现红肿、化脓等情况，需要及时带孩子去医院看医生，进行相应的处理。
需要注意的是，如果孩子发烧持续时间较长、体温较高、精神状态不好或出现其他异常症状，应及时就医，以便明确病因，采取相应的治疗措施。同时，在孩子接种疫苗后，家长应注意观察孩子的情况，让孩子多喝水，注意休息，避免剧烈运动和过度劳累。如果孩子出现异常症状，应及时就医，并告知医生孩子的接种情况，以便医生进行正确的诊断和治疗。