在深呼吸时肺部疼痛，可能是由以下原因引起：
1.胸部损伤：如肋骨骨折、胸部挫伤等，在深呼吸或咳嗽时，会刺激损伤部位，引起疼痛。
2.肺部感染：如肺炎、肺结核等，炎症可导致肺部组织充血、水肿，在深呼吸时，牵拉肺部神经，引起疼痛。
3.胸膜炎：胸膜炎是指由病毒或细菌刺激胸膜所致的胸膜炎症，深呼吸时，两层胸膜相互摩擦，可引起疼痛。
4.气胸：当肺部破裂，空气进入胸腔，可导致气胸，从而引起胸痛，在深呼吸时，疼痛会更加明显。
5.其他：如肺癌、肺栓塞等，也可引起肺部疼痛。
如果出现深呼吸时肺部疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如胸部X线或CT、血常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在就医前，应注意休息，避免剧烈运动，避免劳累和情绪激动，以免加重病情。此外，如果疼痛较为剧烈，可以暂时使用止痛药缓解症状，但应在医生的指导下使用。