先天脑发育不良的治疗方式与病因、病情的严重程度等因素有关，主要包括以下几方面：
1.一般治疗：对先天脑发育不良的患儿，家长应加强对其护理，如保证充足的睡眠、保持皮肤清洁、预防感染等。同时，家长还可以通过游戏、音乐等方式对患儿进行早期教育和训练，促进其智力和运动功能的发育。
2.药物治疗：针对病因进行治疗，如先天性甲状腺功能减退症患儿可使用左甲状腺素钠片进行替代治疗；苯丙酮尿症患儿可使用低苯丙氨酸饮食等。此外，还可以使用一些营养神经、改善脑代谢的药物，如神经节苷脂、脑苷肌肽、奥拉西坦等，以促进脑功能的恢复。
3.手术治疗：对于一些结构性脑畸形，如脑积水、脑脊膜膨出等，可能需要手术治疗。
4.康复治疗：包括物理治疗、作业治疗、语言治疗、心理治疗等，帮助患儿恢复运动功能、语言功能、认知功能等。
5.其他治疗：中医治疗、高压氧治疗等也可能对先天脑发育不良有一定的疗效。
需要注意的是，先天脑发育不良的治疗需要综合考虑患儿的具体情况，制定个性化的治疗方案。同时，家长也需要给予患儿充分的关爱和支持，帮助其树立信心，积极配合治疗。