霉菌性阴道炎常用抗真菌药物治疗，其中克霉唑制剂较为常用，一般使用后2-7天症状可缓解。
局部用药为主
克霉唑制剂：有克霉唑栓，通常1粒（500mg）单次用药即可，也有克霉唑阴道片，1片（150mg），每日1片，连用7日。局部用药能直接作用于阴道局部，抑制真菌生长。咪康唑制剂：像咪康唑栓，2%的咪康唑栓，每晚1粒，连用7日；4%的咪康唑栓，每晚1粒，连用3日。这类药物通过干扰真菌细胞膜的合成来发挥抗真菌作用。
全身用药情况
氟康唑：适用于不能耐受局部用药、未婚女性及不愿采用局部用药者。氟康唑150mg，单次口服。它可抑制真菌细胞色素P450的活性，影响其细胞膜合成。不过，有基础疾病的患者使用时需谨慎，比如有肝脏疾病的患者要在医生评估后使用。
特殊人群用药注意
孕妇：孕妇患霉菌性阴道炎多以局部用药为主，尽量不用全身用药。因为全身用药可能对胎儿有一定影响，局部用药相对更安全，可选择对胎儿影响较小的克霉唑制剂等局部药物。糖尿病患者：这类患者容易反复发生霉菌性阴道炎，除了针对阴道炎的抗真菌治疗外，还需要积极控制血糖。只有将血糖控制在合理范围（一般空腹血糖控制在7mmol/L以下，餐后血糖控制在10mmol/L以下），才能减少阴道炎的复发。同时，在选择药物时也要考虑药物对血糖等代谢指标的影响。