肾穿刺一般来说后遗症发生率较低，但仍可能存在一些情况。
出血相关后遗症
肾穿刺后可能出现局部出血，表现为腰部疼痛等，多数可自行缓解。但少数情况下可能出现较严重的内出血，导致贫血等情况，不过这种情况较为罕见。
感染相关后遗症
若术后护理不当，可能发生感染，出现发热等症状，但通过规范的术后抗感染等处理，大多能得到控制。
损伤周围组织后遗症
极个别情况可能会损伤周围组织，如肠道等，但这种情况发生概率极低。
心理方面后遗症
部分患者可能因对肾穿刺的担忧等出现心理压力，但通过心理疏导等可缓解。对于儿童等特殊人群，家长应给予充分的心理安抚，帮助其减轻心理负担。
