大拇脚趾盖有黑点可能是以下原因引起：
1.甲下淤血：大拇脚趾受到挤压、碰撞等外力作用，导致甲下毛细血管破裂出血，血液淤积在甲床下，就会形成黑点。这种情况通常会随着指甲的生长逐渐向外推移，黑点也会逐渐消失。
2.真菌感染：俗称灰指甲，是由于皮肤癣菌侵犯甲板所致。甲板下的真菌繁殖会导致甲板颜色改变，出现黑点、白斑、增厚、变形等症状。黑点可能是灰指甲的早期表现，需要及时就医，进行真菌检查和治疗。
3.黑素细胞痣：大拇脚趾盖上的黑点也可能是黑素细胞痣，这是一种良性肿瘤，通常由黑素细胞异常增生引起。黑素细胞痣的大小、形状、颜色等可能会发生变化，如果发现黑点逐渐增大、颜色加深、边缘不规则等，需要及时就医，进行病理检查，以排除恶变的可能。
4.其他：营养不良、维生素缺乏、药物副作用等也可能导致大拇脚趾盖出现黑点。
如果大拇脚趾盖上的黑点持续不消失或伴有其他症状，如疼痛、肿胀、变色等，建议及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。