氟牙症主要是由患者在牙齿发育矿化时期摄入过量氟引起的。一般来说，在牙齿发育的特定阶段，比如儿童7岁之前，如果长期饮用含氟量过高的水，就可能导致氟牙症。
一、饮水因素导致
饮水氟含量过高： 当饮用水中氟含量超过1ppm（百万分之一）时，就有可能引发氟牙症。在一些地区，由于地质原因，地下水含氟量较高，长期饮用这样的水，牙齿在发育过程中会受到氟的影响，导致牙釉质发育异常。比如某地区经过检测发现，当地饮用水氟含量达到了1.5ppm，长期生活在该地区的儿童患氟牙症的几率就会明显增加。水源分布差异： 不同地区的水源含氟量不同，山区和丘陵地区的水源含氟量往往比平原地区高一些。如果儿童长期处于水源含氟量高的地区，牙齿发育时接触过多氟，就容易出现氟牙症。
二、食物等其他因素影响
食物中氟含量较高： 某些特定的食物中氟含量也可能较高，比如一些加工食品在生产过程中如果使用了含氟量高的原料，长期食用也可能导致氟摄入过多。像一些含氟农药处理过的农作物，若儿童长期大量食用，也会增加氟牙症的发生风险。空气氟污染： 工业生产中排放的含氟废气，如果周围环境空气氟污染较严重，也可能通过呼吸等途径使人体摄入较多氟。比如附近有氟化工企业的地区，空气中氟含量可能升高，生活在该区域的人群患氟牙症的几率会有所增加。
三、个体差异影响
牙齿发育阶段： 儿童的牙齿发育有特定的时期，一般7岁之前是牙齿发育矿化的关键阶段。如果在这个阶段摄入过多氟，就更容易引发氟牙症。而7岁之后，牙齿发育基本完成，再摄入过量氟，对牙齿的影响相对较小。机体代谢差异： 不同个体对氟的代谢能力不同。有些人代谢氟的速度较慢，即使摄入的氟量在正常范围内，也可能因为代谢不及时而导致氟在体内积累，增加患氟牙症的可能性。