血吸虫病的症状因感染阶段不同而有所差异。急性期时，部分患者会出现发热，热度多在38~40℃，可持续数周。还可能有腹痛、腹泻等肠道症状，每天腹泻3~5次左右，个别患者会有脓血便。同时，可能出现肝脾肿大，肝脏轻度至中度肿大。
急性期症状表现
发热情况： 发热是急性期较典型的表现，体温呈弛张热或间歇热，一般持续1~2个月。有的患者发热伴有畏寒、出汗等症状。肠道症状： 腹痛、腹泻较为常见，腹泻次数一般不多，每天数次，粪便多为糊状，少数带血。部分重症患者可能出现脓血便，里急后重感也可能存在。
慢性期症状表现
消化系统症状： 多数患者有慢性腹泻、腹痛，大便每日2~3次，呈稀糊状，可伴有黏液、脓血。还有些患者会有肝脾肿大的情况，早期以肝肿大为主，尤其是左叶，随着病情进展，脾脏逐渐增大。全身症状： 患者可能有乏力、消瘦、贫血等表现，劳动能力减退，对生活和工作产生一定影响。
晚期症状表现
肝硬化表现： 患者会出现门静脉高压，导致脾肿大进行性增大，脾功能亢进，表现为白细胞、红细胞、血小板减少。还会有腹水，腹壁静脉曲张等情况。部分患者会出现上消化道出血，这是晚期比较严重的并发症，出血量较大时可危及生命。其他表现： 男性患者可能出现睾丸萎缩、性欲减退等；女性患者可能出现月经不调、闭经等情况。晚期患者身体状况较差，生活质量明显下降。