纳氏囊肿是宫颈转化区鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或伸入腺管，将腺管口阻塞，导致腺体分泌物引流受阻、潴留形成的囊肿。一般较小的纳氏囊肿通常无需特殊治疗，若囊肿较大或伴有其他症状可采取不同治疗方法。
一、无症状时的观察随访
多数情况： 很多女性检查发现纳氏囊肿时并无明显症状，这种情况下一般不需要进行特殊治疗，定期（比如每6-12个月）进行妇科检查即可，观察囊肿的大小、形态等有无变化。特殊人群： 对于绝经后的女性，如果发现纳氏囊肿，也可先观察，因为绝经后体内激素水平变化，宫颈情况可能相对稳定。
二、物理治疗方法
激光治疗： 利用激光的热能作用，使囊肿组织碳化、结痂，然后脱落，从而达到治疗目的。治疗时要注意选择合适的能量参数，一般治疗后局部会有轻度的红肿，可能会有少量阴道分泌物增多，通常1-2周可恢复。冷冻治疗： 通过液氮的低温作用，使纳氏囊肿组织坏死、脱落。冷冻治疗后局部可能会出现水疱、渗出等情况，一般1-2周可逐渐愈合。不过冷冻治疗可能对于较大的囊肿效果相对有限。
三、手术治疗情况
囊肿较大或合并其他情况： 如果纳氏囊肿体积较大，或者同时合并有宫颈其他病变，如宫颈息肉等，可能需要进行手术治疗。手术方式包括宫颈囊肿造口术等。宫颈囊肿造口术是用手术刀将囊肿切开，让囊液流出，然后对创面进行适当处理。手术一般在门诊即可进行，术后要注意保持外阴清洁，避免感染，按照医生要求按时复诊。