肾结石的形成与多种因素有关，比如人体尿液中一些物质浓度过高，析出结晶就可能形成结石。一般来说，尿液中钙、草酸、尿酸等成分排出量增加，就容易引发肾结石。
代谢异常方面
尿液成分异常： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等浓度升高时，就容易形成结石。比如尿钙排泄增多，高钙尿症患者尿液中钙含量较高，超过了尿液的溶解度，就容易析出形成钙结石。尿酸代谢异常： 尿酸排泄过多或尿酸化异常时，尿酸会在肾脏内沉积，形成尿酸结石。有研究发现，高尿酸血症患者发生肾结石的风险比正常人高很多。
局部因素方面
尿路梗阻： 尿路梗阻会导致尿液引流不畅，尿液中的结晶容易在局部沉积，进而形成结石。像先天性肾盂输尿管连接部狭窄、输尿管结石等都可能引起尿路梗阻。比如输尿管结石堵塞输尿管，上方尿液积聚，就为结石形成创造了条件。感染因素： 尿路感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使结石形成。细菌可以分解尿液中的尿素，使尿液碱化，从而促进磷酸镁铵及磷酸钙沉积，形成感染性结石。
饮食生活习惯方面
饮水过少： 每天饮水量不足，尿液就会浓缩，尿液中晶体物质的浓度升高，容易析出形成结石。建议每天饮水量保持在2000 - 3000毫升以上，这样能稀释尿液，减少结石形成风险。饮食结构不合理： 长期摄入高嘌呤食物，如动物内脏、海鲜等，会使尿酸生成增多，增加尿酸结石形成风险。而长期摄入高草酸食物，像菠菜、甜菜、巧克力等，会导致尿草酸增多，容易形成草酸钙结石。比如经常吃大量菠菜的人，尿液中草酸含量可能会升高，增加患草酸钙结石的可能性。