身体肌肉疼痛的原因有多种。一般来说，运动过量是常见原因之一，比如突然进行大量运动，像连续慢跑超过1小时，肌肉会产生乳酸堆积，从而导致肌肉疼痛。
运动相关原因
过度运动引发：当人体进行超出自身习惯的运动时，肌肉频繁收缩，会使局部代谢产物堆积，像乳酸积累就会造成肌肉酸痛。这种情况通常在运动后1 - 2天比较明显。运动姿势不当导致：如果运动时姿势不正确，例如举重时姿势错误，会让某些肌肉过度受力，容易引起肌肉拉伤，进而出现疼痛，而且拉伤部位可能会有肿胀现象。
疾病因素导致
感染性疾病：像流感病毒感染后，身体会产生炎症反应，可能引发全身肌肉酸痛，一般还会伴有发热、咳嗽等症状，发热时体温可能会达到38℃以上。自身免疫性疾病：例如类风湿关节炎，会累及关节周围的肌肉，导致肌肉疼痛，同时关节会出现肿胀、僵硬，尤其在早晨起床时症状较为明显，持续时间可能长达30分钟以上。
药物副作用引起
某些降脂药：部分他汀类降脂药可能会有肌肉疼痛的副作用，大约有1% - 5%的服药者会出现不同程度的肌肉疼痛情况，表现为肌肉酸痛、无力等。抗抑郁药：一些抗抑郁药物也可能导致肌肉疼痛，具体发生率因药物种类而异，但也有一定比例的患者会出现此类不良反应。