通常情况下，青春期女生脸上长斑后是否会消失需根据具体病因来判断，不能一概而论。具体如下：
一、若是内分泌紊乱引起的色素沉着，这种情况一般无需过度担忧，也不用进行特殊治疗，通常在青春期结束后有可能自行消退。因为处于青春期时，体内激素水平容易不稳定，从而可能导致内分泌紊乱，进而出现脸部色素沉着长斑的现象。随着青春期结束，激素水平逐渐稳定，长斑的情况可能会改善。
二、但如果青春期女生长雀斑，且多与太阳下暴晒有关，那么一般不会自行消退。这时候需要在医生指导下使用具有祛斑功效的药物，必要时还可以通过激光治疗的方式来祛斑。因为雀斑的形成与紫外线照射有较大关系，若不进行有效干预，很难自行消失。
总之，青春期女生脸上长斑后是否会消失不能简单定论，要明确具体病因，再根据实际情况选择合适的处理方法。