男性尿道炎的治疗药物需根据病原体来选择，一般细菌感染引起的尿道炎，常用抗生素治疗，比如左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素可能有效，但具体用药要遵医嘱。通常一般情况下，明确病原体后针对性用药，大部分能在规范治疗下改善。
不同病原体对应的药物
细菌感染引发的尿道炎：常见的有大肠埃希菌等引起的感染，常用的药物有头孢菌素类，像头孢克肟等，这类药物能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。还有喹诺酮类药物，如诺氟沙星，它可以阻碍细菌DNA复制，达到抗菌效果，但18岁以下青少年一般不建议使用，因为可能影响软骨发育。衣原体或支原体感染导致的尿道炎：常用大环内酯类抗生素，比如阿奇霉素，它能与细菌核糖体结合，抑制细菌蛋白质合成。还有多西环素，属于四环素类抗生素，也可用于治疗衣原体或支原体引起的尿道炎，但孕妇和8岁以下儿童禁用。
用药时的注意事项
过敏情况需留意：如果患者对所用抗生素中的某些成分过敏，就不能使用该类药物。比如对头孢菌素过敏的患者，就不能选用头孢克肟等头孢类药物。用药疗程要保证：即使症状有所缓解，也不能随意停药，一定要按照医生规定的疗程用药，否则容易导致尿道炎反复发作。一般需要连续用药1 - 2周左右，具体时长根据病情严重程度而定。
非药物辅助治疗
大量饮水很重要：患者要增加饮水量，每天保证尿量在2000毫升以上，这样可以多排尿，通过尿液的冲刷作用，有助于将尿道内的细菌等病原体排出体外，减轻炎症。注意个人卫生：要保持会阴部清洁，每天用温水清洗外阴部，勤换内裤，内裤最好选择棉质、宽松的，避免穿紧身化纤内裤，防止局部潮湿有利于细菌滋生。