卵巢囊肿一般不能通过吃药直接消除，不过可以根据囊肿性质等情况用药辅助。对于生理性卵巢囊肿，通常无需特殊用药，多可自行消失；而对于一些病理性卵巢囊肿，可能会用到避孕药等药物。比如短效口服避孕药，它可以通过调节激素水平，抑制卵巢排卵，从而对一些因激素相关引起的卵巢囊肿有一定控制作用，但也不能保证一定能消除囊肿。
生理性卵巢囊肿的情况
多数可自然消退： 部分生理性卵巢囊肿是因月经周期等生理因素引起，比如卵泡囊肿，一般直径多在5厘米以下，通常不需要吃药消除，观察2 - 3个月经周期后，多数可自行消失。无需特殊药物干预： 这类囊肿往往是机体正常生理变化导致，一般不用刻意用药去让它消除，定期复查超声监测囊肿变化即可。
病理性卵巢囊肿的药物辅助
避孕药的作用： 像复方短效口服避孕药，它能通过影响体内激素分泌，抑制卵巢排卵，对于一些因激素失衡导致的卵巢囊肿有一定的调节作用。但它不能保证把囊肿完全消除，而且使用时要按照医嘱规范服用，不能自行随意用药。其他药物情况： 如果是炎症性卵巢囊肿，可能会用到抗生素等药物来控制炎症，但药物主要是针对炎症，而不是直接消除囊肿，且抗生素的使用要根据具体的炎症病菌等情况，由医生来合理选用。
特殊人群用药注意
育龄女性需谨慎： 正在备孕或已怀孕的女性，如果发现卵巢囊肿，用药要特别谨慎。比如孕期一般不建议用可能影响胎儿的药物来针对卵巢囊肿治疗，需由医生综合评估囊肿情况和妊娠情况来决定处理方式。绝经后女性： 绝经后女性出现卵巢囊肿，用药更要小心，因为此时激素水平变化等情况不同，需要医生仔细鉴别囊肿是良性还是恶性等，再决定是否用药及用何种药物。