男人尿发红可能由多种原因引起，比如泌尿系统结石，其中肾结石较为常见，约有10% - 15%的人在一生中会患肾结石。
泌尿系统结石导致
肾结石：肾脏内形成的结石会损伤尿路黏膜，引起出血从而导致尿发红。患者可能还会伴有腰痛，疼痛程度可轻可重，有的是隐痛，有的则是剧烈的绞痛。输尿管结石：结石在输尿管内移动时，也会损伤输尿管黏膜，造成出血，出现尿发红现象，同时会有腰腹部剧烈疼痛，还可能伴有恶心、呕吐等症状。
泌尿系统感染引发
膀胱炎：膀胱发生炎症时，膀胱黏膜充血、水肿，容易出血，导致尿发红。患者除了尿发红外，还会有尿频、尿急、尿痛的症状，尿频可能表现为排尿次数明显增多，一小时内可能多次排尿。肾盂肾炎：肾脏和肾盂发生炎症，也会出现尿发红情况，同时伴有发热、腰痛等症状，发热体温可能会超过38℃。
泌尿系统肿瘤造成
肾癌：肾脏的肿瘤组织生长迅速，血管丰富，容易破裂出血，引起尿发红。早期可能没有明显症状，随着病情发展，可能会出现腰痛、腹部肿块等表现。膀胱癌：膀胱内的肿瘤会破坏膀胱组织，导致出血，出现尿发红，常表现为无痛性的肉眼血尿，也就是尿发红但没有疼痛感觉。
其他可能因素
外伤：如果男性泌尿系统受到外伤，比如腰部受到撞击等，会导致尿路组织损伤出血，引起尿发红。还有些药物也可能导致尿发红，比如使用了利福平，可能会使尿液呈红色，但一般停药后会恢复正常。