新生婴儿黄疸照蓝光一般会有副作用，包括可能出现发热、腹泻、皮疹、刺激眼睛、刺激生殖器官等情况，所以要在正规医院进行治疗。
一、发热：婴儿黄疸照蓝光时可能会引发发热症状，导致体温出现波动。此时要及时补充液体，通常在停止照蓝光后，发热情况能够得到改善。
二、腹泻：部分婴儿还可能出现大便次数增多的现象。如果这种情况不严重，一般在停止蓝光后可逐渐缓解。
三、皮疹：由于婴儿年龄较小，皮肤较为娇嫩，照蓝光时可能对皮肤产生刺激，进而出现皮疹。
四、刺激眼睛：蓝光的光线较强，在照蓝光过程中可能对眼睛造成一定刺激，所以必须要佩戴眼罩来加以保护。
五、刺激生殖器官：照蓝光时也可能对生殖器官造成一定损伤，因此要做好相应的保护措施。
总之，新生婴儿黄疸照蓝光若出现较为严重的副作用时，需要及时配合医生进行治疗。