枕大池囊肿的厉害程度不能一概而论，大部分枕大池囊肿较小且无症状时不严重，可能终身都不会有明显不适。但如果囊肿较大，压迫周围结构就比较厉害，可能出现头痛、头晕、恶心、呕吐，甚至肢体无力、视力改变等症状。
囊肿大小与症状表现
小囊肿情况： 当枕大池囊肿直径小于1厘米时，很多人没有任何症状，通常是在体检做头部影像学检查（如头颅CT或MRI）时偶然发现的，这种情况一般不严重，对日常生活基本没有影响，定期复查头部影像学观察囊肿变化即可。较大囊肿情况： 如果囊肿直径大于3厘米，就有可能压迫周围的脑组织、神经等结构。比如压迫小脑时，可能会出现行走不稳、共济失调的表现；压迫脑干等重要结构时，可能引发严重的头痛、频繁呕吐，甚至影响到肢体的运动和感觉功能，这种情况相对严重，需要进一步评估并考虑治疗。
生长速度与病情进展
生长缓慢的囊肿： 有些枕大池囊肿生长非常缓慢，数年甚至十几年都没有明显变化，这样的囊肿相对没那么厉害，对身体的影响较小。生长较快的囊肿： 少数枕大池囊肿生长速度较快，在较短时间内就明显增大，对周围组织的压迫会迅速加重，症状也会快速恶化，这种情况就比较严重，需要及时就医处理。
引发并发症的风险
无并发症的囊肿： 大部分枕大池囊肿不会引发严重并发症，只要定期监测，平时注意避免头部受到剧烈撞击等可能加重囊肿压迫的因素就行。有并发症的囊肿： 极少数情况下，枕大池囊肿可能会导致梗阻性脑积水等并发症，一旦出现脑积水，会引起颅内压持续升高，出现更严重的头痛、呕吐、视力下降、意识障碍等症状，这种情况就非常严重了，需要紧急处理来缓解颅内压增高的状况，如进行手术引流等。