慢性骨髓炎的治疗需要综合多种方法，一般来说可通过药物治疗、手术治疗等方式来改善。通常治疗周期较长，可能需要数周甚至数月。
药物治疗方面
抗生素使用： 要根据细菌培养和药敏试验结果选择合适的抗生素。一般需要静脉使用抗生素数周，比如可能需要连续静脉滴注抗生素2 - 4周，之后可能根据情况改为口服抗生素继续治疗，总疗程可能长达数月。常用的抗生素有青霉素类、头孢菌素类等。抗炎药物辅助： 可以使用非甾体抗炎药物来减轻炎症反应和疼痛，像布洛芬等非甾体抗炎药，能缓解慢性骨髓炎引起的局部红肿热痛等症状，但要注意其可能对胃肠道等产生的影响。
手术治疗手段
病灶清除术： 通过手术清除死骨、炎性肉芽组织和坏死组织等病灶。手术需要精细操作，要彻底清除病变组织，以促进新的组织生长和感染的控制。比如对于有明显死骨形成的慢性骨髓炎患者，就需要进行病灶清除术。骨移植术： 如果病灶清除后有较大的骨缺损，可能需要进行骨移植。可以采用自体骨移植，从患者自身其他部位取骨移植到病灶处；也可以使用异体骨移植等。自体骨移植相对来说排斥反应小，但取骨部位可能会有一定创伤。
康复护理要点
伤口护理： 要保持伤口清洁，定期换药。如果是术后伤口，要密切观察伤口有无渗血、渗液等情况。一般每天或隔天要进行伤口换药，保持创面干燥，防止感染进一步加重。功能锻炼： 在病情允许的情况下，要进行适当的功能锻炼。比如肢体部位的慢性骨髓炎患者，在炎症控制后，可以进行关节的屈伸等功能锻炼，以防止肌肉萎缩和关节僵硬，但要注意锻炼的强度和频率，避免过度活动导致病情加重，一般每天可进行数次，每次15 - 30分钟左右的适度功能锻炼。