室间隔缺损的手术费用会因多种因素而有所不同，这些因素包括患儿的病情、年龄、体重、有无肺动脉高压以及术后恢复情况等。总体来讲：
一、1-3个月的患儿，其手术费用通常较高，大概需要6万元左右。这是因为该年龄段患儿手术难度相对较大，且术后护理要求较高。
二、3-9个月的患儿，费用会相对低一些，具体可能需要4万元左右，不过这会因所用材料以及是否进行超滤等情况而有所差异。
三、9个月以上的患儿，费用会更少，可能只需3-4万元。
此外，如果患儿肺动脉高压较重、室间隔缺损较大，那么往往费用会更高，可能需要5-6万元。而且依据农合政策以及大病救助限制等情况，患儿的花费也有可能控制在3万元以内。
总结来说，室间隔缺损手术费用是个复杂的问题，受到多种因素综合影响，具体费用需要根据患儿的实际情况来评估确定。