早晨起床后喉咙里有黄痰，可能是由鼻窦炎、慢性咽炎、支气管炎、感冒等引起。具体病因需到医院做相关检查确定。
一、鼻窦炎
若早晨起床后喉咙内有黄痰，同时伴有鼻塞、嗅觉下降等情况，而咳嗽较少或几乎不咳嗽，这可能与鼻窦炎有关。对于免疫力低下的人群，若长期处于高污染环境，或者过度劳累、着凉受寒等，都容易诱发鼻窦炎。鼻窦炎主要是鼻窦黏膜的炎症性疾病，炎症刺激可导致分泌物增多且变得浓稠，当这些分泌物向后倒流至咽部时，就会出现喉咙有黄痰的现象。
二、慢性咽炎
当出现流黄鼻涕且伴有咽喉肿痛、有异物感、干呕、咳嗽等不适症状时，可能与慢性咽炎有关。长期抽烟喝酒、反复发生上呼吸道感染、长期处于高污染环境等因素都可诱发慢性咽炎。慢性咽炎患者的咽部常有各种不适感，如异物感、灼热感、干燥感或微痛感等，当炎症刺激时也会产生痰液。
三、支气管炎
如果咳黄痰的同时还有咳嗽、气喘等表现，则可能与支气管炎有关。气温下降、烟雾、粉尘、吸烟、过敏原刺激等都可诱发支气管炎。支气管炎会导致气道分泌物增多，当这些分泌物混合一些细菌感染产物时，就会形成黄色的痰液。
四、感冒
感冒后通常会有流鼻涕、打喷嚏、咳嗽、咳痰等症状，当合并细菌感染时会出现流黄脓鼻涕、咳黄痰的情况。感冒主要是由病毒感染引起，但当病情发展或合并细菌感染时，就会出现这些更明显的症状。
总之，早晨起床后喉咙有黄痰的原因较为多样，需结合具体症状和检查来明确具体病因，以便进行针对性的治疗。