通常月经结束同房出现褐色分泌物，可能是由残留经血、阴道黏膜出血、宫颈炎等原因造成。可通过改善生活习惯、理疗、药物等方式进行处理。具体如下：
一、残留经血：部分女性经血排出可能不够通畅，会有少量经血或子宫内膜组织残留在宫腔内，当受到情绪或外界某些因素刺激时，这些残留经血就会排出一部分，从而形成褐色分泌物。对此，可在医生指导下应用促进子宫收缩的药物来促使经血排出，比如益母草颗粒、逍遥丸、血府逐瘀颗粒等药物。
二、阴道黏膜出血：若阴道存在炎症，或者性生活过于粗暴，可能导致阴道黏膜破损出血，呈现出褐色分泌物。此时要注意阴道卫生，禁止性生活一周左右，并且可遵医嘱使用硝呋太尔片、盐酸左氧氟沙星片等进行治疗。
三、宫颈炎：这是子宫颈阴道部及宫颈管黏膜的炎症，常见症状包括阴道分泌物增多、异常阴道出血等，同房时也会引起分泌物异常。患者需要遵医嘱进行用药治疗，如阿奇霉素胶囊、金刚藤胶囊等。
此外，还可能存在其他因素导致该情况，例如宫颈息肉、卵巢囊肿、子宫肌瘤等。如果症状一直没有改善，应及时就医进行诊治。
总之，当月经结束同房有褐色分泌物时，要根据具体情况采取相应措施，若情况持续或加重，应及时寻求专业帮助。