巴氏腺囊肿手术两周后同房较适宜。巴氏腺囊肿手术通常是造口术，术后约一周需每日用纱条换药，伤口会逐渐愈合，最终留下针尖大小的口，囊肿内分泌物可从此小孔排出。具体原因如下：
一、换药需一周左右，且还有内部愈合过程，所以两周后同房较好。
1.术后同房时外阴处于摩擦、充血状态，会不利于造口愈合。
(1)若影响组织愈合可能再次发炎，导致巴氏腺脓肿复发。
2.过早同房不合适，两周左右较为恰当。
二、手术常选在月经后3-7天进行，但有人因各种原因在两次月经期间手术，术后两周左右快到月经时间，建议患者等月经干净后再同房。
1.这样经过一个月经周期，手术切口可得到长时间恢复。
2.能更好避免再次发生感染。
总之，巴氏腺囊肿手术后两周再同房为宜。同时术后要注意外阴清洁、干燥，可用中成药洗剂清洗外阴，这有助于伤口愈合，也能避免感染。
总结：巴氏腺囊肿手术后应两周后同房，手术多为造口术且有换药和愈合过程，过早同房可能影响愈合和导致复发，若手术时间特殊，月经后再同房更合适，还需保持外阴清洁干燥以促进恢复和预防感染。