苄星青霉素主要用于预防和治疗某些细菌感染性疾病。一般来说，它可用于预防风湿热复发等情况。
用于预防风湿热复发
预防风湿热初次发作后复发：苄星青霉素可以长期应用来预防风湿热的复发，通常建议成人每月肌肉注射一次苄星青霉素120万单位，儿童可根据体重等情况按相应剂量注射，以降低风湿热复发的风险。
治疗某些链球菌感染性疾病
治疗急性链球菌性咽炎和扁桃体炎：当患者因A组链球菌引起急性咽炎或扁桃体炎时，苄星青霉素可作为有效的治疗药物之一。通过肌肉注射苄星青霉素，能抑制链球菌的生长繁殖，控制感染。例如，对于敏感的链球菌感染，肌肉注射一次苄星青霉素120万单位往往能起到较好的治疗效果。治疗早期梅毒：早期梅毒患者也可以使用苄星青霉素进行治疗。一般采用肌肉注射的方式，通常是每周注射一次，共注射2 - 3次，每次剂量为240万单位，分两侧臀部肌肉注射。通过这种治疗方案可以杀灭梅毒螺旋体，控制病情发展。
用于预防细菌性心内膜炎
心脏瓣膜病等高危人群预防细菌性心内膜炎：对于患有某些心脏瓣膜病等易发生细菌性心内膜炎的高危人群，在进行某些操作（如牙科手术等）前，可使用苄星青霉素来预防细菌性心内膜炎的发生。一般会在操作前肌肉注射苄星青霉素120万单位，以降低在操作过程中细菌感染引发心内膜炎的风险。
注意事项相关情况
过敏者禁用：如果患者对青霉素类药物过敏，那么是严禁使用苄星青霉素的。在使用苄星青霉素之前，必须详细询问患者的药物过敏史，尤其是青霉素类药物的过敏史。肾功能严重损害者慎用：肾功能严重损害的患者使用苄星青霉素时需要谨慎，因为药物的代谢和排泄可能会受到影响，需要医生根据患者的具体肾功能情况来调整用药方案等。