关键点：大拇指指甲有凹陷可能由缺铁性贫血、甲癣、甲营养不良导致，建议根据病因治疗，如缺铁性贫血可用相关药物，甲癣可用特定药物，甲营养不良可补充维生素和微量元素并使用某些药物。
一、缺铁性贫血：缺铁性贫血是由于机体对铁的需求与供给失衡，致使体内贮存铁耗尽、红细胞内铁缺乏而引发的贫血。其常见表现包括乏力、疲倦、头晕、头痛等，还会使指（趾）甲出现缺乏光泽、脆薄易裂，甚至凹下呈勺状等情况。所以，大拇指指甲有凹陷可能是缺铁性贫血引起的。针对此情况，患者可在医生指导下使用硫酸亚铁片、右旋糖酐铁注射液、葡萄糖酸亚铁糖浆等药物进行治疗。
二、甲癣：甲癣是指由皮肤癣菌侵犯甲板及甲下所导致的甲病变。病甲主要呈现出增厚、分离、萎缩、脱落、翘起、表面凹凸不平等状况。因此，大拇指指甲有凹陷可能是由甲癣造成的。患者可在医生的指导下应用盐酸阿莫罗芬搽剂、环吡酮胺乳膏、特比萘芬乳膏等药物进行治疗。
三、甲营养不良：甲营养不良是一种由多因素引起的甲损害。可能会有指（趾）甲变薄、浑浊、变形、易碎等症状。故而，大拇指指甲有凹陷可能是甲营养不良所致。患者可以通过补充维生素A和维生素E、钙、铁等维生素和微量元素来改善情况，同时也可在医生指导下使用氟康唑胶囊、夫西地酸钠软膏、维生素A软胶囊等药物进行治疗
总结概况提示：大拇指指甲出现凹陷可能与多种疾病相关，应明确具体病因后选择合适的治疗方法。