灰指甲医学上称为甲真菌病，彻底根治一般需要综合治疗，通常外用药物治疗可能需要数月时间，口服抗真菌药物一般疗程在3~4个月左右。
外用药物治疗
局部涂抹药物：常用的有阿莫罗芬搽剂，它能通过改变真菌细胞膜的完整性来发挥杀菌作用。一般每周使用1~2次，需要坚持使用几个月，直到新甲长出。不过，外用药物渗透到甲板较困难，对于病情较重或多个指甲受累的情况，单独外用效果可能有限。浸泡药物：可以使用30%冰醋酸溶液浸泡病甲，每天1~2次，每次15~30分钟，但要注意避免药液接触周围正常皮肤，以免造成刺激。不过冰醋酸有一定腐蚀性，使用时需谨慎。
口服抗真菌药物治疗
伊曲康唑：采用冲击疗法，即每次200mg，每天2次，连用7天，停药21天为一个疗程，一般需要2~3个疗程。它具有脂溶性，餐后立即服药吸收更好。但有肝病等基础疾病的患者要慎用，使用前需检查肝功能。特比萘芬：一般每天口服250mg，疗程相对较短，指甲受累的患者通常需要6~8周，趾甲受累的可能需要12周左右。不过也有一些患者服用后可能出现胃肠道不适等反应，肝肾功能不全者需遵医嘱使用。
手术拔甲治疗
手术操作：对于单发的灰指甲，可考虑手术拔甲。但手术创伤较大，术后恢复需要一定时间，而且术后可能会有疼痛、出血等情况，同时术后也需要配合抗真菌药物治疗，防止复发，目前这种方法应用相对较少，因为口服药物治疗效果也较好且创伤小。
日常护理注意事项
保持足部清洁干燥：灰指甲多与足部多汗潮湿有关，要勤换鞋袜，选择透气性好的鞋子。比如每天更换袜子，鞋子最好备两双交替穿，让鞋子有足够时间干燥，减少真菌滋生的环境。避免共用物品：不要与他人共用拖鞋、脚盆、指甲刀等物品，防止交叉感染。因为真菌可以通过这些物品传播，比如在公共浴室、游泳池等场所，要注意避免接触可能被污染的物品。定期修剪病甲：定期适当修剪病甲，但要注意不要过度修剪，以免损伤甲周组织。修剪时使用单独的指甲刀，修剪后要及时清洁消毒指甲刀，防止真菌残留传播。