反流性咽喉炎和反流性食管炎存在以下区别：
一、发病部位不同。反流性咽喉炎主要是因患者胃酸分泌过多而反流至咽喉部所引发的疾病，发病部位在咽喉；反流性食管炎则是胃部食物反流至食管导致食管出现炎症，发病部位为食管。
1.反流性咽喉炎：当出现反流性咽喉炎后，会有咽喉部有异物感、声音嘶哑、发音疲劳、口腔异味、发声困难以及咽喉疼痛等表现。
2.反流性食管炎：临床上会呈现胃酸反流、烧心、恶心、反酸呕吐等症状。
二、治疗药物不同。如果患者患有反流性咽喉炎，可使用奥美拉唑肠溶胶囊、兰索拉唑等药物进行治疗；而若患者患有反流性食管炎，则需要通过服用雷贝拉唑、泮托拉唑来进行医治。
总之，反流性咽喉炎和反流性食管炎在发病部位、症状表现及治疗药物上均有不同，应注意区分和正确诊治。