扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤病，治疗扁平疣的外用药有多种，其中维A酸类药物较为常用，像0.1%维A酸乳膏，一般连续使用数周可能见到效果，但具体起效时间因人而异。
维A酸类外用药：
维A酸乳膏： 通过调节表皮细胞的增殖和分化，促进表皮更新，使扁平疣疣体消退。使用时要注意避免接触眼睛、口腔等黏膜部位。孕妇、哺乳期妇女以及对维A酸过敏者禁用。他扎罗汀凝胶： 属于第三代维A酸类药物，作用机制与维A酸类似，能有效改善扁平疣症状。使用后可能会出现局部刺激症状，如红斑、脱屑等，皮肤敏感者使用需谨慎。
抗病毒类外用药：
咪喹莫特乳膏： 它可以刺激机体产生干扰素等细胞因子，发挥抗病毒和调节免疫的作用。一般每周使用3次，用药6-10周可能有效果。不过，少数人使用后会出现局部炎症反应，如红斑、糜烂等，皮肤破损处不宜使用，孕妇禁用。干扰素凝胶： 具有抗病毒、抑制细胞增殖以及调节免疫的作用。涂抹在疣体上，可能需要持续使用数周才能看到效果。对干扰素过敏者禁用，使用过程中若出现严重的过敏或刺激反应应及时停药。
其他外用药：
水杨酸制剂： 水杨酸可以促进表皮剥脱，从而有助于去除扁平疣。例如水杨酸酒精溶液，使用时要注意不要涂抹到正常皮肤上，以免造成刺激。皮肤有破损、糜烂的部位不宜使用，使用后可能会有局部刺痛等不适。氟尿嘧啶软膏： 它是一种抗代谢药物，通过抑制DNA和RNA的合成发挥作用。但此药有一定的刺激性，可能会引起局部色素沉着等不良反应，面部等皮肤薄嫩部位要慎用，孕妇禁用。