真菌感染和细菌感染存在多方面区别，包括致病菌不同、引起的疾病不同、临床表现不同以及用药不同。具体如下：
一、致病菌不同
1.细菌感染常见的病原菌有金黄色葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、沙门菌、绿脓杆菌等。
2.真菌感染的致病菌包括霉菌、念珠菌、毛癣菌等。
二、引起的疾病不同
1.细菌感染可引发毛囊炎、肺结核、流行性脑脊髓膜炎、疖痈等。
2.真菌感染主要有手足癣、头癣、甲癣、体癣等癣类疾病，同时念珠菌性阴道炎也属于真菌感染性疾病。
三、临床表现不同
1.细菌感染常表现为局部红、肿、热、痛，有时会伴有高热症状。
2.真菌感染可导致红斑、丘疹、脱皮、皮肤瘙痒等表现。
四、用药不同
1.细菌感染需使用抗生素进行治疗，如青霉素、阿莫西林、红霉素、阿奇霉素等。
2.真菌感染则要用抗真菌药物，如特比萘芬、伊曲康唑、克霉唑、酮康唑、咪康唑、益康唑等。
总之，真菌感染和细菌感染在多个方面存在差异，准确区分对于诊断和治疗具有重要意义。