男性体内精子的主要储存部位是精囊，附睾和输精管中也有少量。具体如下：
一、精子的产生与运动：精子在睾丸中生成，之后会进入附睾，附睾是紧贴睾丸的月牙形细条状器官。精子在附睾中可获得能量，这是其运动所需，也是实现授精的关键步骤。
1.精子在睾丸生成：睾丸是精子产生的源头。
2.在附睾中获得能量：附睾为精子提供了运动所必需的能量。
二、精子的成熟与储存：附睾是精子成熟的场所，初级精子会在附睾停留一段时间，成熟后通过输精管运输到精囊储存。
1.附睾使精子成熟：初级精子在此逐渐成熟。
2.成熟精子的运输与储存：通过输精管到达精囊进行储存。
三、射精过程：在正常夫妻生活中男性产生射精冲动时，会通过精囊收缩和输精管运送而出现射精生理过程。
1.精囊收缩的作用：在射精中发挥重要作用。
2.输精管的运送：将精子运出。
总之，男性精子主要存于精囊，初级精子需经睾丸和附睾成熟后才会到达精囊储存，而在射精时涉及到精囊和输精管等的一系列作用。