肛门上长肉疙瘩可能由痔疮、尖锐湿疣、肛周脓肿引起，治疗方法各异。
一、痔疮：多因长期便秘导致。治疗上，可遵医嘱使用马应龙麝香痔疮膏、马应龙痔疮栓等药物，能缓解肛门肿胀疼痛。若病情严重，则可选择手术切除。痔疮是一种常见的肛肠疾病，主要表现为肛门肿物脱出、便血、疼痛等症状。
二、尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染造成，会使肛门出现赘生物。可采用激光治疗，利用高温破坏病变组织，从而去除病变组织。尖锐湿疣具有传染性，主要通过性接触传播，可在肛门、生殖器等部位出现菜花状、乳头状的赘生物。
三、肛周脓肿：通常因感染性因素引起。一旦确诊，需通过手术切开引流，以防止感染扩散。肛周脓肿主要表现为肛门周围疼痛、肿胀、发热等，严重时可伴有全身症状。
总之，当发现肛门上长肉疙瘩时，应及时就医，明确病因，并根据具体情况选择合适的治疗方法。