肾输尿管结石的典型临床表现主要有疼痛和血尿等。一般来说，约半数以上患者会出现肾区或输尿管部位的疼痛，这种疼痛可为隐痛或绞痛，绞痛发作时较为剧烈，如刀割样，可向下腹部、腹股沟、会阴部放射。
疼痛表现：
肾区隐痛或胀痛： 多数患者会有患侧腰部或上腹部的隐痛或胀痛，这是由于结石在肾脏或输尿管内移动缓慢，刺激肾盂或输尿管黏膜引起。比如，一些患者在长时间行走或剧烈运动后，这种隐痛可能会加重。肾绞痛： 当结石在输尿管内移动，造成输尿管梗阻时，就会引发肾绞痛。这种疼痛非常剧烈，常突然发作，患者会辗转不安，疼痛可向同侧下腹部、腹股沟、睾丸或阴唇放射，同时还可能伴有恶心、呕吐等症状。一般肾绞痛发作可持续数分钟至数小时不等。
血尿表现：
肉眼血尿或镜下血尿： 结石活动时，会损伤肾盂或输尿管黏膜，导致出血。多数患者会出现血尿，有的表现为肉眼可见的血尿，尿液呈洗肉水样或鲜红色；有的则需要通过显微镜检查尿液才能发现红细胞，即镜下血尿。一般来说，在疼痛发作后，血尿往往会更加明显。
其他表现：
排尿异常： 如果结石位于输尿管膀胱壁段，可能会引起尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。这是因为结石刺激膀胱黏膜导致的。发热、寒战： 当结石引起尿路梗阻合并感染时，患者可能会出现发热、寒战等全身症状。比如，体温可升高至38℃~39℃甚至更高，同时伴有腰痛加剧、白细胞升高等表现。