喉咙深处有臭味可能由多种原因引起，比如扁桃体结石，扁桃体结石是由于扁桃体隐窝内的食物残渣、细菌、死细胞等物质堆积钙化形成，约有90%的扁桃体结石患者会感觉到喉咙有臭味，有时还会伴有咽部异物感、咳嗽等症状。
扁桃体相关原因
扁桃体结石形成： 扁桃体上有许多小隐窝，正常情况下会有分泌物等排出，但如果分泌物引流不畅，就容易导致钙、镁等无机盐沉积形成结石，从而产生臭味。一般小的结石可能没有明显症状，较大的结石可能会引起不适。慢性扁桃体炎： 患有慢性扁桃体炎时，扁桃体隐窝内会有大量的细菌滋生繁殖，细菌分解产生一些有异味的物质，就会让喉咙深处有臭味。患者可能还会经常感觉喉咙有异物感、发痒、疼痛等。
口腔卫生问题
刷牙不彻底： 如果平时刷牙时没有清洁到喉咙部位，食物残渣在口腔内残留时间过长，就可能滋生细菌产生臭味，进而影响到喉咙深处。比如每天刷牙时间少于2分钟，就可能清洁不彻底。口腔疾病： 像牙龈炎、牙周炎等口腔疾病，会导致口腔内细菌大量繁殖，细菌产生的代谢产物会有异味，也可能传导到喉咙深处，引起臭味。例如牙周炎患者牙龈容易出血、红肿，同时口腔异味明显。
胃肠道问题
反流性食管炎： 胃酸反流至食管甚至口腔咽喉部位，胃酸中的酸性物质会刺激喉咙，而且反流的胃酸带有异味，长期反流就会让喉咙深处有臭味。一般反流性食管炎患者还会有烧心、反酸等症状，尤其是在平卧或进食后更容易出现。消化不良： 当出现消化不良时，食物在胃肠道内停留时间过长，发酵产生有异味的气体，也可能向上反流到喉咙，导致喉咙深处有臭味。比如一次性进食过多油腻食物后，就可能出现消化不良伴喉咙臭味的情况。