水疱型脚气可以通过一般治疗、外用药物治疗、口服药物治疗来改善。一般来说，通过规范治疗，大部分患者能在数周内缓解症状。
一般治疗
保持脚部清洁干燥： 每天用温水清洗脚部，洗完后要彻底擦干，尤其是脚趾间。尽量每天更换袜子，鞋子也要选择透气性好的，比如棉质袜子和帆布鞋等，让脚部保持干爽环境，抑制真菌生长。避免搔抓： 水疱型脚气会有瘙痒感，但要注意不能用手搔抓水疱，以免水疱破裂后引起继发感染，导致病情加重或引发其他部位感染。
外用药物治疗
抗真菌药膏： 常用的有硝酸咪康唑乳膏，它能抑制真菌细胞膜的合成，发挥抗真菌作用。一般每天早晚各涂抹一次，持续使用2 - 4周左右。还有酮康唑乳膏，同样通过抑制真菌麦角固醇的合成来杀菌，用法也是每日早晚外用。溶液湿敷： 如果水疱破裂有渗出，可先用3%硼酸溶液湿敷，每次湿敷15 - 20分钟，每天2 - 3次，起到收敛、清洁创面的作用，之后再涂抹抗真菌药膏。
口服药物治疗
特定情况使用： 当水疱型脚气比较严重，外用药物效果不佳时，可在医生评估下考虑口服抗真菌药物，如伊曲康唑胶囊。但伊曲康唑对肝脏有一定影响，用药前需要检查肝功能，并且要在医生指导下严格按照疗程服用，一般疗程可能需要数周，用药期间要定期监测肝功能。不过口服抗真菌药物相对外用药物副作用稍大，所以一般是在外用药物效果不好或病情严重时才会选用。