脑干损伤后易出现多种情况，比如生命体征紊乱。脑干中有调节呼吸、心跳等重要生命体征的中枢，脑干损伤时，约有半数以上的患者会在伤后早期出现呼吸节律紊乱，像潮式呼吸、叹息样呼吸等，部分患者还可能很快出现呼吸停止。
意识障碍表现
昏迷程度深且持久： 脑干损伤患者通常会立即出现昏迷，且昏迷程度较深，持续时间较长。一般来说，轻度脑干损伤患者可能在数天内逐渐清醒，但中重度损伤患者昏迷时间可长达数周、数月甚至更长时间。去皮质强直： 部分脑干损伤患者会出现去皮质强直现象，表现为两上肢伸直、内收，下肢伸直，头部后仰的特殊姿势。这是因为脑干损伤影响了皮质与皮质下中枢的联系，导致异常的运动反射。
眼部体征变化
瞳孔变化： 脑干损伤时瞳孔变化较为常见。例如中脑损伤时，初期可出现一侧或双侧瞳孔散大，光反射消失，眼球固定等；脑桥损伤时，双侧瞳孔可极度缩小呈针尖样，这是因为脑桥内交感神经纤维受损，而副交感神经相对占优势所致。眼球运动障碍： 脑干内有支配眼球运动的神经核团及传导束，脑干损伤会导致眼球运动障碍，出现双眼向病灶侧同向凝视、眼球分离等情况，影响患者的视觉功能和对周围环境的观察。
运动和反射异常
锥体束征： 脑干损伤常引起锥体束征，表现为受伤平面以下的肢体出现瘫痪，肌张力增高，腱反射亢进，病理反射阳性等。比如上肢屈肌、下肢伸肌痉挛性瘫痪等，这是由于锥体束受损，失去了对脊髓的抑制作用。肌张力改变： 脑干损伤平面以下的肌张力可出现异常，伤后早期可能表现为肌张力降低，随着时间推移，逐渐出现肌张力增高的情况，这与脑干损伤后神经系统的病理生理变化有关，影响了肌肉的神经支配和调节。