备孕爱爱后第三天小腹疼痛，可能与着床有关，但也可能是其他原因引起的。以下是一些可能的情况：
1.着床：着床是指受精卵在子宫壁上着床的过程，通常发生在受孕后的6-12天。一些女性在着床时可能会感到小腹疼痛或轻微出血，这是正常的生理现象。然而，这种疼痛通常是轻微的，并且不会持续很长时间。
2.其他原因：
排卵痛：在排卵期，卵巢会释放卵子，这可能会导致一侧小腹疼痛，类似于月经痛。这种疼痛通常是短暂的，并且会在排卵后自行消失。
盆腔炎：盆腔炎是一种女性生殖系统感染，可能导致小腹疼痛、白带异常等症状。如果备孕期间存在性传播感染或其他感染，可能会增加盆腔炎的风险。
其他妇科问题：子宫肌瘤、子宫内膜异位症等妇科问题也可能导致小腹疼痛。
肠道问题：消化不良、便秘、肠痉挛等肠道问题也可能引起小腹疼痛。
肌肉拉伤或劳损：爱爱过程中的剧烈运动或不当姿势可能导致腹部肌肉拉伤或劳损，引起疼痛。
如果备孕爱爱后第三天小腹疼痛持续或加重，或伴有其他不适症状，如阴道出血、发热、恶心等，建议及时就医。医生会进行详细的身体检查和评估，以确定疼痛的原因，并给予相应的治疗建议。
需要注意的是，着床引起的疼痛通常是轻微的，并且不会持续很长时间。如果疼痛严重或持续时间较长，可能是其他问题引起的。此外，备孕期间应保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、减少压力等，有助于提高受孕机会和胎儿健康。如果对备孕过程有任何疑问或担忧，建议咨询医生或专业的生殖专家。