女性生殖器疱疹主要通过抗病毒药物治疗来缓解症状、缩短病程。一般来说，常用的抗病毒药物有阿昔洛韦等，能在发病后尽快使用，比如在出现症状后的24-48小时内用药效果较好。
抗病毒药物选择
阿昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能干扰疱疹病毒DNA合成，起到抑制病毒复制的作用。可口服给药，对于初发的生殖器疱疹，一般能减轻症状、缩短病程。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，服用后在体内能转化为阿昔洛韦发挥作用，相对来说服用次数可能比阿昔洛韦少，疗效也较好，也可用于女性生殖器疱疹的治疗。
局部治疗方法
清洁护理： 保持生殖器部位清洁干燥很重要，可以用生理盐水清洗患处，避免继发细菌感染。每天用生理盐水轻轻擦拭病变部位2-3次，能减少局部细菌滋生的机会。外用药物涂抹： 可以使用阿昔洛韦乳膏等外用抗病毒药膏涂抹在疱疹患处，能直接作用于局部病毒，辅助全身抗病毒治疗。一般每天涂抹3-5次，坚持涂抹有助于缓解局部症状。
生活方式调整
休息与饮食： 患病期间要注意休息，保证充足的睡眠，一般每天睡眠时间应不少于7-8小时，让身体有足够的精力恢复。同时要注意饮食，多吃富含维生素和蛋白质的食物，如新鲜的蔬菜水果、牛奶、鸡蛋等，增强身体免疫力，一般建议每天摄入蔬菜300-500克、水果200-300克，保证蛋白质的合理摄入。避免性行为： 在生殖器疱疹发作期间，一定要避免性行为，防止将病毒传染给他人，一般建议在皮损完全愈合、无任何症状后再考虑恢复性生活，但即使此时也建议使用安全套，降低传染风险。