胃食道反流是由于多种因素导致食管下括约肌功能障碍，使得胃内容物反流至食管引起的。比如，约有10%-20%的正常人可能会有生理性的胃食道反流，但一般不引起症状或仅偶尔出现。
一、食管下括约肌功能异常
食管下括约肌结构异常： 食管下括约肌是防止胃内容物反流的一道“屏障”，如果其结构出现问题，比如食管下括约肌的肌肉发育不良等，就会导致屏障功能减弱。例如，先天性的食管下括约肌发育不完善，就容易让胃里的东西往上反流。食管下括约肌功能障碍： 一些因素会影响食管下括约肌的正常功能，比如进食过多、过快，或者吃了一些刺激性食物，像辛辣食物、咖啡、巧克力等，这些都可能引起食管下括约肌松弛，从而导致胃内容物反流。
二、食管清除作用降低
食管蠕动异常： 食管正常的蠕动可以帮助将反流到食管的胃内容物往下推送回胃里。如果食管蠕动出现异常，比如蠕动减弱，那么反流物就不能及时被清除。例如，老年人食管蠕动功能可能会随着年龄增长而减退，就更容易发生胃食道反流。唾液分泌减少： 唾液可以起到中和胃酸、清除反流物的作用。当唾液分泌减少时，对反流物的清除能力就会下降。比如一些患有干燥综合征的患者，唾液分泌明显减少，就增加了胃食道反流的风险。
三、胃排空延迟
胃动力不足： 胃排空速度减慢会使胃内食物潴留，胃内压力升高，当压力超过食管下括约肌压力时，就容易发生反流。比如，某些胃肠道疾病患者，像糖尿病患者可能会并发胃轻瘫，导致胃动力不足，胃排空延迟，进而引发胃食道反流。饮食因素影响胃排空： 进食大量高脂肪食物会延缓胃排空。因为高脂肪食物在胃内停留的时间相对较长，会使胃内压力升高，增加反流的可能性。比如一顿饭摄入过多油炸的高脂肪食品后，就比较容易出现胃食道反流的情况。