巧克力囊肿通常会引发腹痛。原因如下：
一、巧克力囊肿在月经期间，局部的异位病灶会出血，进而导致其长大，从而引起腹痛。
二、巧克力囊肿疼痛主要是因为该疾病常致使组织粘连，进而产生腹痛现象。
当巧克力囊肿患者出现腹痛时，可通过以下方式治疗：
1.开腹手术：这是当前治疗巧克力囊肿较为常用的手段，通过切除子宫以及子宫内膜异位病灶，保留卵巢功能以达到治疗目的。具体来说，这种手术方式能够较为彻底地处理病灶，但创伤相对较大，术后恢复时间较长。
2.腹腔镜微孔手术：是在腹部打孔，借助腹腔镜将巧克力囊肿去除。此治疗方法具有微创无痛的特点，副作用较小，且恢复速度快。
术后患者需注意以下方面：要保持规律的作息，避免熬夜和身体过度劳累；在饮食上以清淡为主，避免刺激性食物，多选择易消化、易吸收的食物。
总结：巧克力囊肿易引发腹痛，可通过开腹手术或腹腔镜微孔手术治疗，术后患者要注意作息和饮食等方面。