新生儿肚子疼的病因较多，主要包括消化不良、乳糖不耐受、急性阑尾炎、急性胃肠炎等。一旦出现这种情况，应尽快前往正规医院就诊，明确病因后采取针对性的治疗措施。具体如下：
一、消化不良：多因刚出生就喂养过多导致，此时新生儿胃肠道内奶液积聚过多，会刺激胃肠从而引发肚子疼，可能还伴有放屁多、便秘等表现。可遵医嘱使用双歧杆菌乳杆菌三联活菌片等益生菌类药物进行调理，同时需调整喂养计划，避免一次喂养过多，可改为多次少量喂养。
二、乳糖不耐受：主要是由于先天乳糖酶基因缺乏，致使肠道内的乳糖无法被消化、吸收，进而使新生儿出现腹痛、腹胀、腹泻等症状，也就是肚子疼。建议根据症状严重程度，遵医嘱选择无乳糖或低乳糖牛奶、奶粉，这样可缓解新生儿乳糖不耐受的状况。
三、急性阑尾炎：这通常是由于阑尾腔内有丰富的微生物，易感染到肠壁内的淋巴组织，或者是阑尾管腔阻塞以及细菌入侵等原因引起。炎症刺激极易导致新生儿肚子疼，早期还会有哭闹不安、呕吐等症状，急性期可能会伴有高热、大便带血等情况。轻症可遵医嘱使用头孢呋辛酯颗粒等抗生素，必要时可考虑进行腹腔镜阑尾切除术、开腹阑尾切除术等。
四、急性胃肠炎：一般由细菌感染引发，炎症刺激肠道黏膜会引起新生儿肚子疼，还可伴有呕吐、腹泻等。可遵医嘱使用阿莫西林克拉维酸钾颗粒、布拉氏酵母菌散等药物进行治疗。
总之，当新生儿出现肚子疼时，要及时明确原因，以便进行有效的治疗。