小孩消化不良可以选择一些有助于消化的药物，比如益生菌类药物，像双歧杆菌四联活菌片，它能调节肠道菌群，一般适合各年龄段小孩，不过要注意常温保存。
益生菌类药物：
作用原理： 双歧杆菌四联活菌片里有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等有益菌，能补充肠道有益菌群，改善肠道菌群失衡状况，从而缓解消化不良。适用情况： 对于因肠道菌群失调导致的消化不良，如小孩腹泻、便秘伴随消化不良时都可使用。但要注意，不能和抗生素同时服用，若小孩正在吃抗生素，需间隔2 - 3小时再吃这类益生菌。
促胃肠动力药：
健胃消食片： 这是常用的促进消化的药物，主要成分有太子参、陈皮、山药等，能促进胃肠蠕动，帮助消化。一般3岁以上小孩可以在医生指导下服用，不过不能过量，过量可能会引起小孩肠胃不适。它适用于小孩饮食不节引起的消化不良，比如小孩吃多了肉类、甜食等导致的腹胀、积食等情况。
助消化酶制剂：
乳酶生片： 乳酶生是活肠球菌的干燥制剂，能在肠道内分解糖类生成乳酸，使肠内酸度增高，从而抑制腐败菌的生长繁殖，并防止肠内发酵，减少产气，起到帮助消化和止泻的作用。2岁以上小孩可以服用，适用于小孩消化不良、腹胀及小儿饮食失调所引起的腹泻、绿便等。但要注意，不能与抗菌药物、吸附剂同时服用，如必须服用，间隔时间最好在3小时以上。胃蛋白酶合剂： 能消化蛋白质，小孩消化不良时，若有胃蛋白酶分泌不足的情况可以在医生指导下使用，不过要根据小孩年龄调整合适的剂量，一般3岁以上小孩可在饭后服用，它适用于蛋白性食物消化障碍的消化不良。但对胃蛋白酶过敏者禁用，小孩使用时要注意观察有无过敏反应等情况。