治肛周脓肿的费用一般在几千元到上万元不等，具体费用受到多种因素影响。
治疗方式影响费用
手术治疗费用：如果是单纯性肛周脓肿，采用一次性切开引流手术，费用相对较低，大概在3000~8000元左右。但如果是复杂性肛周脓肿，可能需要多次手术，费用会相应增加，可能达到1万元以上。因为复杂性肛周脓肿手术操作更复杂，恢复时间长，使用的材料等成本也更高。非手术治疗费用：非手术治疗主要是抗生素抗感染等，一般药物费用相对较低，可能每天几百元，但需要持续用药，总体费用可能在几千元左右。不过非手术治疗效果有限，很多肛周脓肿还是需要手术治疗。
医院等级影响费用
基层医院费用：在一些基层医院，治肛周脓肿的费用相对较低。单纯性肛周脓肿切开引流可能在3000~5000元左右。基层医院的医疗设备和人力成本相对较低，所以收费标准会低一些。三甲医院费用：三甲医院的收费通常会高一些。因为三甲医院医疗技术水平更高，设备更先进，专家团队更强大。单纯性肛周脓肿在三甲医院行切开引流术，费用可能在5000~1万元甚至更高。
地区差异影响费用
经济发达地区费用：在经济发达的大城市，治肛周脓肿的费用普遍较高。比如北京、上海等城市，单纯性肛周脓肿手术费用可能在8000元以上。因为这些地区的医疗成本高，包括场地租赁、人员工资等成本都比较高。经济欠发达地区费用：在经济欠发达的地区，治肛周脓肿的费用相对较低。单纯性肛周脓肿切开引流可能在2000~5000元左右。地区的经济发展水平直接影响医疗收费标准。