慢性咳嗽的治疗需根据病因来定。一般来说，找到病因后针对性处理很关键。比如因上气道咳嗽综合征引起的慢性咳嗽，要积极治疗鼻部疾病。
因上气道咳嗽综合征的治疗
鼻腔局部治疗： 可以用生理盐水冲洗鼻腔，每天可进行2 - 3次，能清除鼻腔内的分泌物、过敏原等，减轻鼻腔炎症对咽喉部的刺激。全身药物治疗： 若有细菌感染迹象，可短期使用抗生素，如阿莫西林等，但需在医生判断有感染时使用，一般不超过1周。
因咳嗽变异性哮喘的治疗
吸入糖皮质激素： 常用的有布地奈德气雾剂等，通过吸入方式作用于气道，减轻气道炎症。一般需要长期规范使用，部分患者可能需要持续数月甚至更长时间。支气管舒张剂： 像沙丁胺醇气雾剂，能缓解气道痉挛，改善咳嗽症状，可在咳嗽发作时按需使用，但不建议长期单独使用。
因胃食管反流性咳嗽的治疗
生活方式调整： 患者要避免进食过饱，睡前3小时不宜进食。睡觉时可将床头抬高15 - 20厘米，减少夜间胃酸反流。药物治疗： 常用质子泵抑制剂，如奥美拉唑等，能抑制胃酸分泌，一般需要服用4 - 8周左右，具体时间根据病情调整。