宝宝40度高烧持续两小时以上会有多种危害，包括引起惊厥、昏迷、呼吸困难等。具体来说：
一、超过39度属于高热，40度以上是超高热，超高热会使患儿皮肤大量出汗，导致水分大量丢失，从而出现脱水症状。
1.患儿会因水分流失而感到口渴等。
2.可能出现口唇发干等表现。
二、持续两小时以上的超高热会对神经系统产生不良影响，引发惊厥、昏迷等问题。
1.惊厥发作时可能出现肢体抽搐等现象。
2.昏迷则会使患儿意识不清。
三、极高的体温还可能引起呼吸急促、呼吸困难等情况，若不及时治疗或治疗不当，会导致呼吸衰竭，威胁生命。
1.呼吸急促会表现为呼吸频率加快。
2.呼吸困难会让患儿感觉憋气难受。
当宝宝出现这种情况时，患儿可遵医嘱口服布洛芬混悬滴剂、对乙酰氨基酚颗粒等药物进行降温。同时，可采用温水擦浴等物理降温方式辅助降温，如将湿毛巾敷在患儿额头、脖子等部位，或者用温水直接擦拭手心、脚心、腋窝等部位。发热时患儿容易口渴、食欲不佳，要鼓励患儿多喝淡盐水以补充水分。家长应及时带患儿到医院就诊，避免对患儿身体健康造成不良影响。总之，对于宝宝的高烧情况要高度重视，及时采取恰当措施进行处理。