注射用头孢他啶适用于多种由敏感菌引起感染的人群。一般来说，它对革兰阴性杆菌感染引起的疾病有较好的疗效。
下呼吸道感染患者
肺炎患者：由肺炎克雷伯菌、流感嗜血杆菌等敏感菌引起的肺炎，可使用注射用头孢他啶进行治疗。例如，在医院收治的因肺炎克雷伯菌感染导致下呼吸道感染的患者中，经使用头孢他啶治疗后，多数患者的感染症状能得到改善。慢性支气管炎急性发作患者：当慢性支气管炎急性发作是由铜绿假单胞菌等敏感菌引发时，注射用头孢他啶可发挥作用。比如一些老年慢性支气管炎患者，在急性发作期分离出铜绿假单胞菌，使用头孢他啶后病情能得到控制。
尿路感染患者
急性肾盂肾炎患者：由大肠埃希菌等敏感菌导致的急性肾盂肾炎，注射用头孢他啶可以用于治疗。临床研究显示，部分急性肾盂肾炎患者使用头孢他啶后，尿液中的细菌数量逐渐减少，感染症状缓解。复杂性尿路感染患者：对于一些伴有尿路结构异常等情况的复杂性尿路感染，若由敏感菌引起，注射用头孢他啶也有一定的治疗价值。像一些糖尿病患者合并复杂性尿路感染，分离出敏感菌时，使用头孢他啶能起到抗感染的作用。
腹腔、胆道感染患者
腹腔感染患者：由敏感菌引起的腹腔感染，如腹膜炎等，注射用头孢他啶可用于治疗。在一些因肠道细菌移位引发的腹腔感染病例中，使用头孢他啶后，患者的腹腔感染情况得到改善。胆道感染患者：当胆道感染是由敏感菌导致时，注射用头孢他啶能发挥抗菌作用。例如一些胆囊炎患者，在确定是敏感菌感染引起胆道炎症时，使用头孢他啶可控制感染。
皮肤软组织感染患者
重度皮肤软组织感染患者：对于由敏感菌引起的重度皮肤软组织感染，如大面积脓肿等，注射用头孢他啶可以应用。比如一些因金黄色葡萄球菌等敏感菌导致的重度皮肤软组织感染患者，使用头孢他啶后，感染部位的炎症逐渐消退。