男性生殖器长小肉疙瘩，常见原因包括毛囊炎、过敏性皮炎、皮脂腺囊肿、尖锐湿疣等。
一、毛囊炎：
主要是因病原菌感染导致。其症状除了生殖器上有小肉疙瘩外，往往还伴有明显的瘙痒感。针对这种情况，患者可遵医嘱外用红霉素软膏或糠酸莫米松乳膏等药物进行治疗。
二、过敏性皮炎：
通常会引发黏膜出血性反应。首先要及时脱离过敏原，然后进行抗过敏治疗。一般可使用氯雷他定分散片、盐酸西替利嗪片等抗过敏药物，具体用药需严格遵循医嘱。
三、皮脂腺囊肿：
多为单发，平时可能无显著症状，但当发生细菌感染时，会出现红肿、化脓以及疼痛等表现。此时建议患者考虑通过囊肿切除手术来治疗，具体治疗方案应严格依照医嘱执行。
四、尖锐湿疣：
这是一种常见的性传播疾病，主要通过性行为传播。部分患者会有异物感、瘙痒、疼痛、性交不适等症状。患者务必及时进行有效治疗，可在医生指导下应用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物；同时可采用冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗以及手术治疗等方式来去除疣体。
此外，扁平湿疣、软纤维瘤也可能引发该症状。所以当出现这种情况时，建议患者及时前往医院进行检查和治疗，以避免对身体造成损害。
总之，男性生殖器出现小肉疙瘩的原因多样，需要根据具体情况进行准确诊断和恰当治疗。