口腔溃疡时，含漱氯己定含漱液比较好，它能有效杀菌，一般使用0.2%浓度的，可抑制口腔内细菌生长，缓解口腔溃疡的炎症反应。
含药物成分的漱口水
氯己定含漱液： 主要通过吸附在细菌表面，改变细菌细胞膜通透性来杀菌，对口腔溃疡常见的致病菌有抑制作用，能减轻红肿、疼痛等症状，使用时按说明书稀释后含漱。西吡氯铵含漱液： 属于阳离子表面活性剂，能抑制菌斑形成，对口腔溃疡有一定辅助治疗作用，可降低口腔内细菌数量，促进创面愈合。
天然成分的漱口水
金银花含漱液： 金银花有清热解毒的功效，用其制成的含漱液能缓解口腔溃疡带来的不适，可减轻局部炎症，一般没有明显副作用，适合口腔溃疡症状较轻者使用。绿茶含漱液： 绿茶中含有的茶多酚等成分具有抗菌、抗炎作用，用冲泡后的绿茶冷却后含漱，能在一定程度上帮助口腔溃疡恢复，且口感相对较好。
普通清洁型漱口水
不含药物的普通漱口水： 像一些含有温和表面活性剂的普通漱口水，能清洁口腔，减少食物残渣对口腔溃疡创面的刺激，但对于治疗口腔溃疡本身的作用相对较弱，主要起辅助清洁口腔的作用，可在饭后或睡前使用，保持口腔清洁。不过要注意，儿童使用时需在成人监护下，避免误吞。