手足口病儿童夜里反复哭闹，可能原因包括手足口病本身引起的不适以及可能出现的并发症。此时应及时就医以排除并发症。
一、手足口病本身所致：
手足口病由肠道病毒感染导致，是急性出疹性疾病。儿童会有发热、身体不适、腹痛、皮疹等表现，皮疹常于发热1-2天后出现。儿童夜里反复哭闹可能是这些不适症状导致。临床上对此病无特效药物，主要是遵医嘱用布洛芬缓释胶囊退热，不建议用抗病毒药物，通常2周内可自行恢复。
二、并发症所致：
部分儿童病情较重，可能出现脑膜炎并发症，如头痛、烦躁、肌无力等，也可能出现肺炎并发症，如呼吸急促、口唇发绀等。这些并发症会使症状加重，从而引起儿童夜里反复哭闹。此时家长需立刻带儿童去医院就诊，并针对并发症进行治疗。如对出现脑膜炎的儿童可遵医嘱用甘露醇降颅压，以及使用甲泼尼龙片等药物来缓解症状。
总之，当手足口病儿童夜里出现反复哭闹时，要考虑到可能是疾病本身或并发症引起，应尽快就医明确原因并采取相应措施。