引起葡萄膜炎的最主要原因是自身免疫性疾病，大约有50%左右的葡萄膜炎是由自身免疫性疾病引发的。
自身免疫性疾病相关
类风湿关节炎相关： 类风湿关节炎患者中约有20% - 30%会并发葡萄膜炎。这类患者体内的自身抗体攻击关节等组织的同时，也可能累及眼部的葡萄膜组织，导致炎症发生。强直性脊柱炎相关： 强直性脊柱炎患者出现葡萄膜炎的概率相对较高，约10% - 20%的强直性脊柱炎患者会并发葡萄膜炎，主要是因为自身免疫紊乱使得免疫系统错误地攻击眼部葡萄膜结构。
感染因素相关
细菌感染相关： 某些细菌感染可引发葡萄膜炎，比如结核杆菌感染。结核杆菌感染人体后，其抗原成分可能会引发免疫反应，波及眼部葡萄膜，导致炎症。病毒感染相关： 单纯疱疹病毒感染是引起葡萄膜炎的常见病毒因素之一。约有10% - 20%的单纯疱疹病毒性角膜炎患者会继发葡萄膜炎，病毒在眼部潜伏或复发时，会激活免疫系统，导致葡萄膜炎症。
创伤及理化损伤相关
眼内手术创伤相关： 进行眼内手术时，如白内障手术、青光眼手术等，手术操作可能会损伤眼部组织，引发炎症反应，其中就包括葡萄膜炎。据统计，眼内手术后约有5% - 10%的患者会出现葡萄膜炎。眼部外伤相关： 眼部受到外伤，如眼球被撞击、异物进入眼内等，会破坏眼部的正常结构和免疫平衡，从而诱发葡萄膜炎。眼部外伤后发生葡萄膜炎的概率因外伤严重程度不同而有所差异，一般在10% - 30%左右。