龟头起了一层小水泡可能是多种原因引起的，比如单纯疱疹病毒感染，这种情况通常是由单纯疱疹病毒Ⅱ型引起，在性接触后可能会感染，一般潜伏期为2~14天。
一、单纯疱疹病毒感染导致
症状表现： 初期龟头等部位可能出现红斑，随后迅速发展为小水疱，水疱可单个或多个，伴有疼痛或瘙痒感。水疱可能会破溃形成糜烂面，然后逐渐结痂愈合。传播途径： 主要通过性接触传播，也可通过密切接触感染者的疱液而感染。
二、龟头炎引发
细菌性龟头炎： 不注意局部卫生，细菌滋生可能引起龟头炎，也可能出现小水疱情况，同时还可能伴有龟头红肿、疼痛、有分泌物等表现。比如大肠杆菌感染引起的细菌性龟头炎，局部会有炎症反应导致水疱出现。念珠菌性龟头炎： 多发生在包皮过长或包茎的人群中，由于局部潮湿，念珠菌繁殖引发炎症，龟头可出现红斑、小水疱，伴有瘙痒，分泌物呈豆腐渣样。
三、过敏因素导致
接触性过敏： 比如使用了不合适的避孕套、新换的内裤材质等，接触到过敏原后，龟头可能出现过敏反应，表现为小水疱，同时可能伴有龟头瘙痒、红肿等症状。一般在接触过敏原后数小时至数天内发病。药物过敏： 服用某些药物后也可能引起龟头过敏，出现小水疱，同时可能伴有全身其他部位的过敏表现，如皮疹、瘙痒等。