胎儿做亲子鉴定主要有两种常见方式，一种是羊水穿刺亲子鉴定，另一种是无创胎儿亲子鉴定。羊水穿刺亲子鉴定一般在妊娠16-22周进行，穿刺时需抽取约20ml羊水，费用大概在2000-3000元左右；无创胎儿亲子鉴定则是在怀孕5周以上就可以做，通过采集孕妇外周血，利用新一代DNA测序技术对母体外周血中的游离DNA片段进行测序分析，从而得出胎儿的遗传信息，费用相对较高，大概在5000-8000元左右。
羊水穿刺亲子鉴定
采样时间： 通常在妊娠16-22周进行，这个时间段羊水相对充足，胎儿活动度小，穿刺抽取羊水相对安全。采样过程： 医生会先通过超声定位，确定胎儿和胎盘的位置，然后用细针经腹部刺入羊膜腔，抽取约20ml羊水。羊水里面含有胎儿脱落的细胞，通过对这些细胞进行DNA检测，就能得到胎儿的亲子鉴定信息。注意事项： 羊水穿刺有一定的流产风险，大约在0.5%-1%左右，所以术前需要孕妇充分了解风险，并签署知情同意书。另外，术前要确保孕妇没有感染等情况，如果有急性感染性疾病则不适合进行羊水穿刺。
无创胎儿亲子鉴定
采样时间： 怀孕5周以上就可以进行，比羊水穿刺的时间更早，能更早得知鉴定结果。采样过程： 只需要采集孕妇的外周血，一般采集10ml左右的静脉血即可。因为孕妇外周血中含有少量胎儿游离的DNA，通过高科技手段分离出这些游离DNA，再进行测序分析，与假定父亲的DNA进行比对，从而得出胎儿与假定父亲是否存在亲子关系。注意事项： 无创胎儿亲子鉴定相对安全，流产风险几乎为0，但也不是完全没有风险。不过风险非常低。而且这种方法也有一定的适用范围，比如孕妇有过流产史等特殊情况时，需要医生评估是否适合做无创胎儿亲子鉴定。同时，要选择正规的有资质的机构进行检测，以保证结果的准确性。
绒毛穿刺亲子鉴定
采样时间： 一般在妊娠11-14周进行。这个时期胎儿的绒毛已经形成，可用于亲子鉴定。采样过程： 医生会通过超声引导，用细针经阴道或腹部刺入胎盘部位，吸取少量绒毛组织。然后对绒毛组织中的细胞进行DNA检测来确定亲子关系。注意事项： 绒毛穿刺也存在一定的风险，比如导致胎儿流产的风险大概在1%-2%左右，同时还可能引起胎儿肢体畸形等问题。所以术前也需要孕妇充分了解风险，并且只有在医生认为必要的情况下才会建议进行绒毛穿刺亲子鉴定，比如孕妇有某些特殊的医学指征等情况。